СКР назвал Михаила Ходорковского возможным заказчиком убийства мэра Нефтеюганска. По словам официального представителя Следственного комитета РФ Владимира Маркина, бывший руководитель ЮКОСа мог быть причастен и к другим особо тяжким преступлениям. Маркин добавил, что Ходорковского собираются вызвать на допрос. Отмечается, что отсутствие его в России не помешает работе следователей.
По версии СКР, в 1998-2002 годах члены организованной группы по указанию экс-акционера ЮКОСа Леонида Невзлина совершили ряд убийств, в том числе мэра Нефтеюганска Владимира Петухова. Невзлин заочно приговорён к пожизненному заключению, сам он с 2003 года проживает в Израиле. Виновным в организации убийства мэра Нефтеюганска признан экс-сотрудник службы безопасности Алексей Пичугин. Сейчас он отбывает наказание по приговору суда.